大致來講，玻璃鋼化糞池運作也就四步：過濾沉淀－厭氧發(fā)酵－固體物分解－糞液排放。
一般來說，我們把一個大的池子分成三格或四格，三格叫三級化糞池，四格叫四級化糞池。污水首先由進水口排到第一格，在第一格里比重較大的固體物及寄生蟲卵等物沉淀下來，利用池水中的厭氧細菌開始初步的發(fā)酵分解，經(jīng)第一格處理過的污水可分為三層：糊狀糞皮、比較澄清的糞液、和固體狀的糞渣。
玻璃鋼化糞池經(jīng)過初步分解的糞液流入第二格，而漂浮在上面的糞皮和沉積在下面的糞渣則留在第一格繼續(xù)發(fā)酵。在第二格中，糞液繼續(xù)發(fā)酵分解，蟲卵繼續(xù)下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產(chǎn)生的糞皮和糞渣厚度比第一格顯著減少。
流入第三格的糞液一般已經(jīng)腐熟，其中病菌和寄生蟲卵已基本殺滅。第三格功能主要起暫時儲存沉淀已基本無害的糞液作用，最后，經(jīng)過再次沉淀的糞液通過排水管流入市政管網(wǎng)。四級化糞池則比三級化糞池多了一道發(fā)酵腐化的工序，工藝更細化，水質(zhì)更干凈。